Дисбактериоз, обусловленный синегнойной палочкой, обычно возникает у лиц со сниженными защитными свойствами организма, ранее перенесшими острые кишечные инфекции (дизентерия, сальмонеллез и др.) или длительно страдавших неспецифическим язвенным колитом, хроническим энтероколитом и болезнями других органов пищеварения, а также после лечения антибиотиками. Патоморфологически процесс может быть катаральным, фибринозно-гнойным с очагами некроза и геморрагиями с последующим образованием эрозий и язв. Если синегнойный энтероколит является результатом пищевой токсикоинфекции, заболевание развивается остро, протекает с выраженной интоксикацией, болями в животе, повторной рвотой, частым жидким стулом с примесью комочков слизи. Больные обычно погибают в первые дни или на 7-10-е сутки от начала болезни от сердечно-сосудистой недостаточности и паралитического илеуса.

Синегнойный дисбактериоз, развившийся после применения антибиотиков, протекает более доброкачественно, клиническая картина менее выражена, исход благоприятный. Тяжело протекает энтероколит при смешанной синегной-ностафилококково-протеусной инфекции. При нем чаще отмечается генерализация процесса с метастатическими очагами в паренхиматозных органах, интоксикацией, исходом в сепсис.

Диагноз ставят на основании клинической картины и бактериологического исследования кала с выделением палочки синего гноя.